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[這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯]}uh;K
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好
在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面tMF%F 遇到有台灣深山的時候 通常都會說:J"=KH 台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種_* 最近在論壇上面看到 有人也覺得有東部型JDF^\h ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 s 所以難免會讓人想知道PxlTb 它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本)O42p4 或是 這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異{OW ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 0TZ2 很多的書都寫著 這樣的關係值得深入去探討/+N 但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論Nu 因此 最近收到一些標本的我 就先把手頭上有的個體分析%kk ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 &'[ 我所用的方法 是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係-F/j6> 用這個方法得到資料比較快 而且我也比較熟悉o (用養的要花很久的時間、很多的空間,對我來說比較困難)h< ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ;]uxrR 以下是我有的個體分佈圖IS[XZ- ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 wbr[r
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按此查看圖片詳細資料"e: ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Bpv"j ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 a<+ (圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)skqUi 最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來d^D4 下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山=CwK3h ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 wKI 中部藍色為溪頭及杉林溪,~[ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 y@ 南部綠色為阿里山 及東部的利佳林道和南橫栗園H{ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 `q! 東部灰色是瑞穗林道Quy (論壇如果不能公布地點,請告訴我,我會把這一段d掉)jQAGS? ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 C 一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置Z+X8K 有一點與現今台灣政治顏色相同 所以這樣標D 如果看了不舒服 非常抱歉W ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 'Ji
一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNA50-9' (NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多);1 後來知道現在bar coding是用CO1 所以我就用CO1來分析'N34d CO1在粒線體的位置如下:;:Q ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 n[
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按此查看圖片詳細資料N^Y5 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 5,4Vn ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 { ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 WI.e}_ 我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primers1 Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014)1& G| ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 <z
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按此查看圖片詳細資料{t4`' ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 )%K3]k ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ]4n|_G ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 s+aF PCR之後 切膠純化 然後作TA cloning.(P)~E 總共的長度是1302個basepairsp8I (因為是universal primer pair,他不是很專一,直接定序不好看。而且$- 1302個basepairs必須要再設計一組internal primerssWn_+- 才能得到完整漂亮的序列,乾脆用clone比較方便 )Ki#w.o ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 qO 選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群WJ8]C/ (期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像 也許是姊妹群)g ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 H_ckj_ 用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)d<5,Y* 然後用Mega跑Parsimony analysisb&5cB ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 #o 以下的圖是24個most parsimony tree的consensus treerrt ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 kX.U.
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按此查看圖片詳細資料6 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 `0oexN ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 :!VViZ (TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山9g9%$ NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道b~8 TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)a5 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 tG 從CO1的結果來看 台灣深山的各族群遺傳結構;Wp 已經在地理上有很明顯的分化(structured populations)-y ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Dx 大概分成中北部、中南部及東部三群!Ww,n 其中看的出來方向性 嘉義阿里山最先進來台灣, 然後分成東部的族群 以及中北部的族群' 中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶6 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 }4 f
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按此查看圖片詳細資料?Oo(| ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 %g+ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 X~5$ ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Q$ze 以上大概就是初步的結果Qpw%l0 畢竟我每個地方的個體不多 而且點也很少(d 所以你也可以不相信我的結果!eK ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 !) 無論如何6 這是一個值得繼續作下去的題目FJbjv' 至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大S_+ 我可以找到的相關文獻在這Bp|l http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdfrKm 台灣深山似乎也有類似allometry的現象+ 族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多T_q 族群密度地的地方似乎比較少v\;0]B 而這樣的結果在目前的分析看來 似乎有遺傳的差異純在了+<o 不過還是一句 我的sample size很小 他依舊可能是型態的可塑性d ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Cyyf 大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點g]ZE_x 但是我沒辦法和我的結果連想起來
相關資料也不多(大多是長度&重量)j76ay9 ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 R4>tPr 以後還要多收集不同產地的台灣深山Ei 以及多去博物館量外部型態特徵G (想要到交易版徵有確切產地的蟲,可是不敢 呵呵)\;k!c ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 E 感謝很多送我標本的人4Uz, 裡面只有溪頭一隻是我自己抓的Abe [x 其他的夢蟲無我老闆提供很多 +y 嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等&&JY6 非常感謝k$hA 外群是跟zozo買來的乾標本\i (PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本,我都可以抽出DNA 得意中)c8:\wE ©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 8+
好了 在論壇潛水很久 好像做了一點事 哈哈i-E$b 希望畢業前這個alternative作的完 "或是有人接"(變向的招收學生)u
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