| |
[這篇文章最後由airbugsHuang在 2011/01/05 06:06pm 第 2 次編輯])
這一篇文章po在這其實是我不知道要po在哪比較好 
在台灣鍬形蟲的圖鑑裡面Bq
遇到有台灣深山的時候 通常都會說：WNR
台灣深山有分成北部型、中部型以及南部型三種\
最近在論壇上面看到 有人也覺得有東部型n@~''#
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 =mAD?_
所以難免會讓人想知道K*
它們這樣的變化是一定的嗎(這個需要量很多標本)lM
或是 這些型態上又差別的族群是不是也已經在遺傳上有差異8
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 c
很多的書都寫著 這樣的關係值得深入去探討nc\
但是目前為止還沒找到相關的paper有對台灣深山的討論.=-yC<
因此 最近收到一些標本的我 就先把手頭上有的個體分析b2EZ
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 i{;Y|
我所用的方法 是以分子層次的變化來比較各族群之間的關係^.2UV
用這個方法得到資料比較快 而且我也比較熟悉z`BI)
(用養的要花很久的時間、很多的空間，對我來說比較困難)+.@%mw
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 s
以下是我有的個體分佈圖leNVKM
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ;<I1X
 此主題相關圖片如下：mF
 OQ6
 >/
 按此查看圖片詳細資料@V f
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 `
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 A3ku
(圖片是用許老師2000年paper中的台灣圖修改)~goDIo
最北邊紅色的部分為北縣三峽以及烏來lX-z)
下方紅色為北橫巴嶺及拉拉山9FC
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 AKk
中部藍色為溪頭及杉林溪*0}}Q%
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 W
南部綠色為阿里山 及東部的利佳林道和南橫栗園#]v
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 BWv
東部灰色是瑞穗林道}X
(論壇如果不能公布地點，請告訴我，我會把這一段d掉)z:RjC%
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 33M
一樣的顏色是之前我比較常看到大家所說的各個型分佈位置"
有一點與現今台灣政治顏色相同 所以這樣標Moqe
如果看了不舒服 非常抱歉k:<"Sf
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Y
一開始我所選擇的Gene Region有mt CO1 region及mt16SrDNAR~eI
(NCBI上面這兩段基因序列使用分享最多)q,&(8
後來知道現在bar coding是用CO1 所以我就用CO1來分析?i;}
CO1在粒線體的位置如下:7[(
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 a
此主題相關圖片如下：AdF/
 }$,eU5
ENp3=6
按此查看圖片詳細資料Rv3yif
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 (<R^H
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 .
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Bwo3gS
我所使用的primer pair是simon(1994)的insect universal primersQ
Foreward : C1-J-1751 及 Reverse: TL-N-3014>"B/J
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 2B
此主題相關圖片如下：,IN!F
 ;
pp
按此查看圖片詳細資料H
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 PUI7`
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 o(r/
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 XN
PCR之後 切膠純化 然後作TA cloning.m
總共的長度是1302個basepairsTak
(因為是universal primer pair，他不是很專一，直接定序不好看。而且O{`|Na
1302個basepairs必須要再設計一組internal primersd!%}
才能得到完整漂亮的序列，乾脆用clone比較方便  )ok
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 >/S6_8
選了Lucanus hermani及Lucanus laetus當外群1O
(期中Lucanus hermani與台灣深山長的很像 也許是姊妹群)Z-
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 !(u+
用clustalV 作對齊(alignment是這樣翻嗎)>46
然後用Mega跑Parsimony analysisr>w)
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 Mcvz`
以下的圖是24個most parsimony tree的consensus treeUmRmh
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 _
此主題相關圖片如下：X@]
 rC
]h$|O
按此查看圖片詳細資料*h3))]
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 2n
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 -9r
(TPss北縣三峽、TPwl北縣烏來、TYbl北橫巴領、TYlls北橫拉拉山#8BoHe
NTst南投溪頭、NTsls南投杉林溪、CYala嘉義阿里山、TDlc台東利佳林道i
TDly南橫栗園、HLjs花蓮瑞穗林道)`v#$G+
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 O
從CO1的結果來看 台灣深山的各族群遺傳結構 kG
已經在地理上有很明顯的分化(structured populations).
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 ]
大概分成中北部、中南部及東部三群cHdo_F
其中看的出來方向性 嘉義阿里山最先進來台灣`TKJ/}
然後分成東部的族群 以及中北部的族群+,
中部南投山區也許是北部及南部族群的重疊地帶/pB0
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 9Y
此主題相關圖片如下：Q{E,j
 *2fv
HdA([g
按此查看圖片詳細資料V;n&SR
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 pC>
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 'i
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 KK
以上大概就是初步的結果>
畢竟我每個地方的個體不多 而且點也很少 CGQO/
所以你也可以不相信我的結果3nps
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 m$i
無論如何h%j?
這是一個值得繼續作下去的題目"KCub
至於各個地方的大顎為什麼會變化的那麼大(]
我可以找到的相關文獻在這LtW~a(
http://web.thu.edu.tw/g942505/www/Population%20density%20drives%20the%20local%20evolution%20of%20a%20threshold%20dimorphism%20JLT%20&%20GSB%20Nature%202004.pdf,[K=?O
台灣深山似乎也有類似allometry的現象jz.
族群密度比較高的地方大型雄蟲放到大顎的能量比較多1mp
族群密度地的地方似乎比較少kV
而這樣的結果在目前的分析看來 似乎有遺傳的差異純在了;]H*40
不過還是一句 我的sample size很小 他依舊可能是型態的可塑性Cs
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 -05
大顎的彎曲程度也是大家在分產地的重點i
但是我沒辦法和我的結果連想起來 
相關資料也不多(大多是長度&重量)_PJ
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 d^Y
以後還要多收集不同產地的台灣深山$
以及多去博物館量外部型態特徵WVnk
(想要到交易版徵有確切產地的蟲，可是不敢  呵呵)a
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 e
感謝很多送我標本的人V6
裡面只有溪頭一隻是我自己抓的D9CA;
其他的夢蟲無我老闆提供很多 o
嘉義大學的同學去年送我兩隻阿里山的個體等等<a :
非常感謝?HV&
外群是跟zozo買來的乾標本,pC[sC
(PS.只要是沒有發黴過或被蟲子吃過的乾標本，我都可以抽出DNA  得意中)\h`lZ
©昆蟲論壇 -- 昆蟲論壇 NNh }
好了 在論壇潛水很久 好像做了一點事 哈哈?h&[a
希望畢業前這個alternative作的完 "或是有人接"(變向的招收學生)A-
| |
頂端 
加到"我的最愛"
主題管理：
總固頂 
取消總固頂 
短訊息
查看
搜尋
通訊錄
引用
回覆
2006/10/08 03:25:55pm 
IP: 已設定保密
